一是做好收获前的各项准备工作。一些根类药材如果种植面积较大，需要提前购买收获机械，提高收获效率；另外，还要准备好晾晒或烘干场地，以便于收获药材及时干燥，避免鲜药材不易保管导致的损失。

二是对于低洼易积水的地块，要作好疏通排水沟的工作。让田间达到较为干爽的程度，以方便采收机械的进入。

三是这一时期肥料基本上不需要施用了，如果施用的话可使用叶面肥，以利于营养物质向贮存器官的运输。

四是关注药材生长情况，及时收获。大力子和薏苡等不及时采收会因落粒减产，如薏苡一般是在种子80%成熟时即可收割，晾晒1周后就可以进行脱粒；红花会因为采收不及时，干燥后花颜色不正，影响销售价格，而且遇到连阴雨时，红花种子会在植株上萌发；五味子和枸杞采收过早会出现油性不足、色泽不正常的现象，采收过晚则容易出现果实变软、采摘破损导致干后黑粒现象。

五是随着气温逐渐降低，虽然很多病害已经开始减轻，但是病害防治仍然不能放松。目前一些药材容易发生白粉病、褐斑病、疫病等，对药材的产量影响很大。目前，有农民反映一些农药不好用的问题，研究发现，是病原菌对一些传统的农药有了耐药性。因此，要尽量采用新型农药，可从中国农药网上查找这类农药。如用吡唑醚菌酯防治芍药褐斑病和枸杞白粉病；用蛇床子素防治芍药和枸杞白粉病；用戊唑醇防治黄芪白粉病；嘧菌酯防治黄芩和板蓝根白粉病；氨基寡糖素防治人参疫病、五味子和榛子白粉病等。

六是中药材收获后还要及时清洁田园，避免病虫害在落叶上越冬。